Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RUNDC1Q96C34 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RUNDC1Q96C34 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms