Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1BQ8WUY9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPDC1BQ8WUY9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms