Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3RF3Q8TEJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms