Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPPL3Q8TCT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPPL3Q8TCT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms