Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms