Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC24Q8N4L8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC24Q8N4L8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC24Q8N4L8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms