Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP50Q70EL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP50Q70EL3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms