Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP1R3FQ6ZSY5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R3FQ6ZSY5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms