Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNI2Q6ZMN8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms