Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms