Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNNM4Q6P4Q7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNNM4Q6P4Q7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms