Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF3Q5VWG9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms