Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PDE4DIPQ5VU43 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms