Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM78Q5T7P6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM78Q5T7P6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms