Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD3Q5JV73 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMPD3Q5JV73 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms