Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDRF1Q3B7T1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDRF1Q3B7T1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms