Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IMPG1Q17R60 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IMPG1Q17R60 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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