Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HADHQ16836 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HADHQ16836 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HADHQ16836 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HADHQ16836 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HADHQ16836 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HADHQ16836 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms