Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDSNQ15517 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDSNQ15517 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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