Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKD1Q15139 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKD1Q15139 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKD1Q15139 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKD1Q15139 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKD1Q15139 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRKD1Q15139 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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