Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SEMA3AQ14563 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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