Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL9A3Q14050 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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