Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MSLNQ13421 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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MSLNQ13421 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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