Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3BQ13214 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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