Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHAF1AQ13111 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHAF1AQ13111 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms