Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 GRE2YOL151W 1029 nt3.6□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YPL035CYPL035C 348 nt3.6□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 SWT1YOR166C 1377 nt3.6□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 PKP2YGL059W 1476 nt3.6□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 SMP3YOR149C 1551 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 HRD1YOL013C 1656 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 BUD6YLR319C 2367 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YCR090CYCR090C 549 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 snR7-SsnR7-S 179 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YDR413CYDR413C 576 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YDR431WYDR431W 312 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YEL057CYEL057C 702 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 GPP2YER062C 753 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YER137W-AYER137W-A 306 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YFL015CYFL015C 495 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 COX8YLR395C 237 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 BET5YML077W 480 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 CDC33YOL139C 642 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 TCB3YML072C 4638 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YNR065CYNR065C 3351 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 GYP6YJL044C 1377 nt3.59□□□□□ -1.83
MSL5Q12186 YML096WYML096W 1578 nt3.59□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 CDC14YFR028C 1656 nt3.59□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 TEL1YBL088C 8364 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 snR59snR59 78 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 snR65snR65 100 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 AAD3YCR107W 1092 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 NOP6YDL213C 678 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YDR090CYDR090C 933 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YDR537CYDR537C 606 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 GCN4YEL009C 846 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 PDX1YGR193C 1233 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 BIO2YGR286C 1128 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 IDP2YLR174W 1239 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 UNG1YML021C 1080 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YBR032WYBR032W 303 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 DIB1YPR082C 432 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 ARR2YPR200C 393 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 UPC2YDR213W 2742 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 NCS2YNL119W 1482 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 REB1YBR049C 2433 nt3.58□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 LRG1YDL240W 3054 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 MRH1YDR033W 963 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SPG3YDR504C 384 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SWC4YGR002C 1431 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 MNL1YHR204W 2391 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 MPS3YJL019W 2049 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YAL065CYAL065C 387 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YKE2YLR200W 345 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 FBP1YLR377C 1047 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 RPS16AYMR143W 432 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SYT1YPR095C 3681 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 PHO88YBR106W 567 nt3.57□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 PER1YCR044C 1074 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 MRPL11YDL202W 750 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YDR230WYDR230W 348 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YDR262WYDR262W 819 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 MFA1YDR461W 111 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YGR025WYGR025W 303 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 NBL1YHR199C-A 222 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 ILV5YLR355C 1188 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 VAM10YOR068C 345 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 OST2YOR103C 393 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SHE4YOR035C 2370 nt3.56□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 JIP5YPR169W 1479 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SSH1YBR283C 1473 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 TGL3YMR313C 1929 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 BUD13YGL174W 801 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SWI1YPL016W 3945 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 SRO7YPR032W 3102 nt3.55□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 AYT1YLL063C 1425 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YNR063WYNR063W 1824 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YER097WYER097W 330 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YGR073CYGR073C 372 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 OTU2YHL013C 924 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 EPT1YHR123W 1176 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 TDA8YAL064C-A 381 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YAR029WYAR029W 225 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 YLR434CYLR434C 384 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 RIM9YMR063W 720 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 USA1YML029W 2517 nt3.54□□□□□ -1.84
MSL5Q12186 NUP85YJR042W 2235 nt3.54□□□□□ -1.84
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