Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM27E3Q08E93 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms