Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TGM3Q08188 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TGM3Q08188 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms