Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 AFR1YDR085C 1863 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ATP6Q0085 780 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 MIC19YFR011C 513 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YHR213WYHR213W 597 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ACF4YJR083C 930 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 TDA8YAL064C-A 381 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YAR062WYAR062W 597 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YLR416CYLR416C 399 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPN13YLR421C 471 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 DYN3YMR299C 939 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 PDR17YNL264C 1053 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CSI2YOL007C 1026 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 STI1YOR027W 1770 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CIN8YEL061C 3003 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 NCS2YNL119W 1482 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CCM1YGR150C 2595 nt3.01□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RVS161YCR009C 798 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 LIF1YGL090W 1266 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPF1YHR088W 888 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YIL029CYIL029C 429 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPS28BYLR264W 204 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YNL150WYNL150W 408 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YBR051WYBR051W 351 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 TPK2YPL203W 1143 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 GIS4YML006C 2325 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 SHS1YDL225W 1656 nt3□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 TGL3YMR313C 1929 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 FLO5YHR211W 3228 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 GAL80YML051W 1308 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 SKN7YHR206W 1869 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPN1YHR027C 2982 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YCR001WYCR001W 315 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YDL050CYDL050C 372 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 SNA4YDL123W 423 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 AIM11YER093C-A 414 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YGL082WYGL082W 1146 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 MTC3YGL226W 372 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 MTM1YGR257C 1101 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YNL122CYNL122C 348 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RCY1YJL204C 2523 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CIN1YOR349W 3045 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RAD5YLR032W 3510 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPN3YER021W 1572 nt2.99□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 XRN1YGL173C 4587 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ENA2YDR039C 3276 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ENA1YDR040C 3276 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 EMI1YDR512C 564 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 MXR1YER042W 555 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CDC26YFR036W 375 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YGR018CYGR018C 330 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CIC1YHR052W 1131 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CPR7YJR032W 1182 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YJR157WYJR157W 363 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPL22AYLR061W 366 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ARC18YLR370C 537 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RHO5YNL180C 996 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YPR053CYPR053C 456 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RIM13YMR154C 2184 nt2.98□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YDR061WYDR061W 1620 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ARP4YJL081C 1470 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ADY4YLR227C 1482 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 TIF4631YGR162W 2859 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 SWC4YGR002C 1431 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YJL132WYJL132W 2253 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 snR59snR59 78 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RSM24YDR175C 960 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 FMP32YFL046W 624 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YGL159WYGL159W 1113 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 VEL1YGL258W 621 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YGR045CYGR045C 363 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 CSE4YKL049C 690 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPL15AYLR029C 615 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YLR076CYLR076C 423 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YLR257WYLR257W 966 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RPS16AYMR143W 432 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 MRPL44YMR225C 297 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 GOT1YMR292W 417 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YNL203CYNL203C 612 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 RSM19YNR037C 276 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 ATP25YMR098C 1839 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 PHR1YOR386W 1698 nt2.97□□□□□ -1.93
SSK1Q07084 YBR259WYBR259W 2067 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 RTT105YER104W 627 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 EAF6YJR082C 342 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YKL202WYKL202W 582 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 FYV7YLR068W 456 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 OST6YML019W 999 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YAT2YER024W 2772 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YDL176WYDL176W 2127 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 RED1YLR263W 2484 nt2.96□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 HFD1YMR110C 1599 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 SKO1YNL167C 1944 nt2.95□□□□□ -1.94
SSK1Q07084 YMR317WYMR317W 3423 nt2.95□□□□□ -1.94
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