Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAD51Q06609 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD51Q06609 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms