Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
SRSF11Q05519 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF11Q05519 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF11Q05519 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF11Q05519 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF11Q05519 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF11Q05519 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms