Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F1Q01094 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms