Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CLTCQ00610 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLTCQ00610 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms