Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZBED6P86452 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED6P86452 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms