Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLF3P57682 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF3P57682 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLF3P57682 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLF3P57682 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF3P57682 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF3P57682 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms