Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSFP46459 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSFP46459 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSFP46459 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NSFP46459 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSFP46459 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSFP46459 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSFP46459 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NSFP46459 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSFP46459 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSFP46459 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSFP46459 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms