Protein–RNA interactions for Protein: P43366

MAGEB1, Melanoma-associated antigen B1, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEB1P43366 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAGEB1P43366 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms