Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPHP41219 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPHP41219 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPHP41219 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPHP41219 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPHP41219 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPHP41219 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPHP41219 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPHP41219 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPHP41219 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPHP41219 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPHP41219 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms