Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 ECL1YGR146C 636 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YKL044WYKL044W 321 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 GTT2YLL060C 702 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 LEE1YPL054W 906 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YPR050CYPR050C 414 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 FKH2YNL068C 2589 nt3.69□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 MSK1YNL073W 1731 nt3.68□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YCR064CYCR064C 411 nt3.68□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 SEC53YFL045C 765 nt3.68□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YFL065CYFL065C 309 nt3.68□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.68□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 CTK3YML112W 891 nt3.68□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YBR225WYBR225W 2703 nt3.68□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 PEX5YDR244W 1839 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 LYP1YNL268W 1836 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YDR338CYDR338C 2088 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 OSH3YHR073W 2991 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 EAP1YKL204W 1899 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YMR018WYMR018W 1545 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 UTP15YMR093W 1542 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 SNA4YDL123W 423 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 IES5YER092W 378 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 RPS8BYER102W 603 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 CMS1YLR003C 876 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 AIM4YBR194W 372 nt3.67□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YRR1YOR162C 2433 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 BAR1YIL015W 1764 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 STE14YDR410C 720 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 API2YDR525W 330 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 ECM4YKR076W 1113 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 DAD2YKR083C 402 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 SFM1YOR021C 642 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 CAT5YOR125C 702 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 MGR2YPL098C 342 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YPL278CYPL278C 303 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 MPS1YDL028C 2295 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 SYT1YPR095C 3681 nt3.66□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 PCK1YKR097W 1650 nt3.65□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 YNL193WYNL193W 1677 nt3.65□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 SSF1YHR066W 1362 nt3.65□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 FAS1YKL182W 6156 nt3.65□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 SQS1YNL224C 2304 nt3.65□□□□□ -1.82
SSZ1P38788 IRC2YDR112W 309 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 FRQ1YDR373W 573 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YGL015CYGL015C 393 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 GET1YGL020C 708 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 HUR1YGL168W 333 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 POG1YIL122W 1056 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RPL13BYMR142C 600 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 DDR48YMR173W 1293 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YDR061WYDR061W 1620 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 SPA2YLL021W 4401 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 DAN4YJR151C 3486 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 HRD1YOL013C 1656 nt3.65□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YPR022CYPR022C 3402 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RED1YLR263W 2484 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 MAK5YBR142W 2322 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 OPI6YDL096C 327 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 HIS5YIL116W 1158 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RNH203YLR154C 333 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 MRPL40YPL173W 894 nt3.64□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 FAT1YBR041W 2010 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 HSP30YCR021C 999 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 SMT3YDR510W 306 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 ECO1YFR027W 846 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 CDC26YFR036W 375 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 MRP49YKL167C 414 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 CWC24YLR323C 780 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 TVP18YMR071C 504 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RAD14YMR201C 1116 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YNL181WYNL181W 1224 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RIO2YNL207W 1278 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RPN2YIL075C 2838 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YAK1YJL141C 2424 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 PPN1YDR452W 2025 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 CWH41YGL027C 2502 nt3.63□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 BI4Q0120 1917 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RUD3YOR216C 1455 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 PWP2YCR057C 2772 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YKR078WYKR078W 1758 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RTR1YER139C 681 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YGR073CYGR073C 372 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 RTS3YGR161C 792 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 HRI1YLR301W 735 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 HHF1YBR009C 312 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 YOR277CYOR277C 309 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 PIS1YPR113W 663 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 MUD2YKL074C 1584 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 CDC40YDR364C 1368 nt3.62□□□□□ -1.83
SSZ1P38788 TMA108YIL137C 2841 nt3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.3 ms