Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL4P36578 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL4P36578 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL4P36578 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPL4P36578 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL4P36578 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL4P36578 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL4P36578 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL4P36578 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms