Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXA9P31269 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms