Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA10P31260 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA10P31260 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms