Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMBRP28336 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMBRP28336 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMBRP28336 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NMBRP28336 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NMBRP28336 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NMBRP28336 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NMBRP28336 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMBRP28336 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMBRP28336 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMBRP28336 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms