Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SSFA2P28290 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SSFA2P28290 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms