Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KB1P23443 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KB1P23443 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms