Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCNA2P20248 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms