Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB8P17481 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms