Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 ECI1YLR284C 843 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 GIM3YNL153C 390 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PDR17YNL264C 1053 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YCL020WYCL020W 1317 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PAM1YDR251W 2493 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 EPL1YFL024C 2499 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 BRE5YNR051C 1548 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 MDV1YJL112W 2145 nt2.62□□□□□ -1.99
MSI1P13712 NSA1YGL111W 1392 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YDR061WYDR061W 1620 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 CHS2YBR038W 2892 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 SLK19YOR195W 2466 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 GIS4YML006C 2325 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YDL163WYDL163W 303 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 CPR5YDR304C 678 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 CKA1YIL035C 1119 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PHD1YKL043W 1101 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YET1YKL065C 621 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YLR012CYLR012C 300 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 IRC21YMR073C 606 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 ATX1YNL259C 222 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 STE23YLR389C 3084 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 HBT1YDL223C 3141 nt2.61□□□□□ -1.99
MSI1P13712 CHO2YGR157W 2610 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 TIF4631YGR162W 2859 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 JIP5YPR169W 1479 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 FAA2YER015W 2235 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PHO81YGR233C 3537 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 snR5snR5 204 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PBP4YDL053C 558 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 NTF2YER009W 378 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 RPB9YGL070C 369 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PEX18YHR160C 852 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 ECM9YKR004C 1134 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 ARC18YLR370C 537 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PAI3YMR174C 207 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 CSI2YOL007C 1026 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YOL029CYOL029C 606 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 TPK2YPL203W 1143 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 FRE8YLR047C 2061 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 UBX3YDL091C 1368 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 TFC1YBR123C 1950 nt2.6□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YCG1YDR325W 3108 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 SKP2YNL311C 2292 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 JJJ1YNL227C 1773 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 DYN2YDR424C 279 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 EMI1YDR512C 564 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 NSA2YER126C 786 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YGR017WYGR017W 894 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 COG2YGR120C 789 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 EFG1YGR271C-A 702 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 PCL5YHR071W 690 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 ASG7YJL170C 630 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YMR254CYMR254C 309 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 YNL235CYNL235C 432 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 AFT2YPL202C 1251 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 LOA1YPR139C 903 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 MUD1YBR119W 897 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 AIM4YBR194W 372 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 FLO5YHR211W 3228 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 RGC1YPR115W 3252 nt2.59□□□□□ -1.99
MSI1P13712 RIM13YMR154C 2184 nt2.59□□□□□ -2
MSI1P13712 POL3YDL102W 3294 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 OCA6YDR067C 675 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 RSM24YDR175C 960 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 TMA20YER007C-A 546 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 VEL1YGL258W 621 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 RPL11BYGR085C 525 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 YIL175WYIL175W 318 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 RPL17BYJL177W 555 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 MBB1YJL199C 327 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 YJR087WYJR087W 351 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 SFT1YKL006C-A 294 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 VMA6YLR447C 1038 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 YPL107WYPL107W 747 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 RPL11AYPR102C 525 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 YPR170CYPR170C 336 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 GYL1YMR192W 2163 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 RCY1YJL204C 2523 nt2.58□□□□□ -2
MSI1P13712 CIK1YMR198W 1785 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 SNA4YDL123W 423 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 PPH3YDR075W 927 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 YDR442WYDR442W 393 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 EMC4YGL231C 573 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 YGR107WYGR107W 450 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 YJL169WYJL169W 369 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 BUD19YJL188C 309 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 MBA1YBR185C 837 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 ASI3YNL008C 2031 nt2.57□□□□□ -2
MSI1P13712 CBP2YHL038C 1893 nt2.56□□□□□ -2
MSI1P13712 MSH2YOL090W 2895 nt2.56□□□□□ -2
MSI1P13712 HEH2YDR458C 1992 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.5 ms