Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARGP13631 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARGP13631 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RARGP13631 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARGP13631 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARGP13631 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARGP13631 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARGP13631 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARGP13631 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RARGP13631 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RARGP13631 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms