Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGFR1P11362 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGFR1P11362 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms